Hoewel het SwanX docking station veel te bieden heeft, zijn er ook enkele minpunten. Het grootste nadeel is het beperkte aantal poorten. Er is geen DisplayPort, geen SD-kaartlezer, en geen 3,5mm audio-aansluiting. Voor gebruikers die een microSD willen uitlezen of een tweede monitor willen aansluiten, is dit een gemis. De USB-C poort naar het apparaat is alleen voor data en opladen; er is geen aparte data-link, wat betekent dat de dock niet als hub voor data kan fungeren zonder het apparaat aan te sluiten. De HDMI 2.0 ondersteunt 4K@60Hz, maar geen 1440p@120Hz of hogere verversingsfrequenties, wat voor sommige pc-gamers minder gunstig is. De USB 3.0 poorten zitten aan de achterkant, waardoor ze minder toegankelijk zijn als de dock op een bureau staat. Ook de kabel tussen dock en console is vast en relatief kort (circa 15 cm), wat de positionering beperkt. Tot slot: de dock wordt warm tijdens gebruik, vooral bij het opladen en gamen tegelijk, hoewel het binnen veilige temperaturen blijft.